2020/04/21(火)Ubuntu 20.04 インストール (4)

vi大好きなのでvimを入れます。
sudo apt install vim
また、~/.vimrcを、
set encoding=utf-8
set fileencodings=iso-2022-jp,euc-jp,sjis,utf-8
filetype indent off
という内容で作成しました。これにより、
  • 日本語のファイルを認識させる。デフォルトのコードがUTF8になり、JIS、EUC、SJISコードのファイルも自動認識して編集できるようになる。
  • 18.04からvimが賢くなってファイルの拡張子に応じて自動でインデントしてくれるようになったが、自分はエディタが勝手に何かするのが嫌いなのでそれを止める。
を設定しています。

2020/04/21(火)Ubuntu 20.04 インストール (3)

普段研究で作成する文書類はすべてubuntuで書いています。TeX系のソフトウェアが安定して使えるかは重要。
sudo apt install texlive-lang-cjk
sudo apt install texlive-fonts-recommended
sudo apt install texlive-fonts-extra
sudo apt install xdvik-ja
普段、platexでコンパイルして、dvipdfmxでpdfにして、evinceで見ています。xdvikはもう要らないかな。

(2021/4/21追記) 日本語フォントを埋め込むときは dvipdfmx -f ptex-ipa.map hogehoge.dvi としてます。正しいかどうかは知りません。

その他文書作成関連のソフトウェアをついでに入れました。
sudo apt install gv
sudo apt install nkf
sudo apt install gnuplot
sudo apt install tgif
sudo apt install gimp
sudo apt install inkscape
sudo apt install mimetex
sudo apt install latexdiff
sudo apt install diffpdf
sudo apt install pdftk-java
pdftk (pdfからページを抜き出したりできるツール) は18.04では消されていたものが復活しました。

2020/04/21(火)Ubuntu 20.04 インストール (2)

vmware toolsは、vmwareのゲストで
  • デスクトップのリサイズ、
  • ホストOSとのクリップボード共有(文字列のコピペが出来るようになる)、
  • フォルダ共有
などを実現するもので、ゲストOSへのインストールはほぼ必須です。vmware標準で提供されるものは無視してopen-vm-toolsを入れるのがお薦めです。18.04のときと違って、自動的にインストールされ、スクトップのリサイズもクリップボード共有も最初から動作していました。もしそうなっていなければ、
sudo apt install open-vm-tools-desktop
としましょう。

共有フォルダは、vmwareの「設定→オプション→共有フォルダの有効化」で共有フォルダを有効にして再起動。
sudo vmhgfs-fuse -o allow_other -o auto_unmount .host:/ /mnt/hgfs
で/mnt/hgfs以下にマウント出来ました。永続的にmountするには、/etc/fstabで
.host:/ /mnt/hgfs fuse.vmhgfs-fuse allow_other,auto_unmount,defaults 0 0
と書くとよいでしょう。

2020/04/21(火)Ubuntu 20.04 インストール (1)

Ubuntu 20.04が間もなくリリースされます。

18.04以来2年ぶりのLTS (Long Time Support)で、5年間のサポート期間があります。半年毎にアップデートするのは面倒なのでLTSを愛用しています。

というわけで、20.04のインストールメモです。20.04betaを使って試しました。多分リリース版でも変わっていないと思います。betaでもとても調子がよく、また過去の例ではbetaを入れてもアップデートを繰り返していれば自然とリリース版と同等になるそうで、このまま使い続けるつもりです。

Ubuntu 20.04 LTS (Focal Fossa) Betaから、ubuntu-20.04-beta-desktop-amd64.isoをダウンロードしました。数日以内にベータでなくなるはずです。

VMwareで作業しました。新規仮想マシンの作成→標準→後でOSをインストール。仮想マシンの種類はLinux Ubuntu 64bit。ディスクはデフォルトの20Gじゃ少ないので512Gに増やしました (ここを多くしても実際に仮想マシン内で使用しない限りホストマシンのディスクを圧迫することはありません)。メモリはとりあえずデフォルトの2Gで (こちらは大きくするだけホストマシンのメモリを食います)。仮想マシンの設定でisoをマウントし起動。
  • 言語は「日本語」を選び、「Ubuntuをインストール」をクリック。
  • キーボードレイアウトは「Japanese」「Japanese」
  • 「通常のインストール」を選ぶ。
  • 「Ubuntuのインストール中にアップデートをダウンロードする」、「グラフィックスとWi-Fiハードウェアと追加のメディアフォーマットのサードパーティ製ソフトウェアをインストールする」をチェック
  • 「ディスクを削除してUbuntuをインストールする」を選ぶ。
  • 「インストール」をクリック。
  • TimeZoneは「Tokyo」を選ぶ。
  • 「ログイン時にパスワードを要求する」を選ぶ。
インストールは全く問題なく終了しました。

とりあえず端末を出すには、右下のBCGの痕みたいなアイコンをクリックして「端末」を選びます。右クリックして「お気に入りへ追加」するといいでしょう。

日本語をかな漢字変換で入力するには、インストール直後の一回だけ、右上の「ja」をクリックして、「日本語(Mozc)」を選ぶ必要があります。

(4月24日追記)

4月23日に、予定通り20.04LTSが正式にリリースされました。

Ubuntu 20.04 LTS (Focal Fossa)から、ubuntu-20.04-desktop-amd64.isoをダウンロードすればいいです。このインストール日記(1)-(10)の手順を全てやり直してみましたが、Juliaのversionが1.3.0から1.4.1に変わっていた以外は特に違いはありませんでした。

なお、beta版に対して、「ソフトウェアの更新」をかけたところ、/etc/os-releaseが、
NAME="Ubuntu"
VERSION="20.04 LTS (Focal Fossa)"
ID=ubuntu
ID_LIKE=debian
PRETTY_NAME="Ubuntu Focal Fossa (development branch)"
VERSION_ID="20.04"
HOME_URL="https://www.ubuntu.com/"
SUPPORT_URL="https://help.ubuntu.com/"
BUG_REPORT_URL="https://bugs.launchpad.net/ubuntu/"
PRIVACY_POLICY_URL="https://www.ubuntu.com/legal/terms-and-policies/privacy-policy"
VERSION_CODENAME=focal
UBUNTU_CODENAME=focal
から、
AME="Ubuntu"
VERSION="20.04 LTS (Focal Fossa)"
ID=ubuntu
ID_LIKE=debian
PRETTY_NAME="Ubuntu 20.04 LTS"
VERSION_ID="20.04"
HOME_URL="https://www.ubuntu.com/"
SUPPORT_URL="https://help.ubuntu.com/"
BUG_REPORT_URL="https://bugs.launchpad.net/ubuntu/"
PRIVACY_POLICY_URL="https://www.ubuntu.com/legal/terms-and-policies/privacy-policy"
VERSION_CODENAME=focal
UBUNTU_CODENAME=focal
に変わって、ちゃんとリリース版になったようです。

2020/02/12(水)kv-0.4.50

kvライブラリを0.4.50にアップデートしました。

今回は、卒論修論のシーズンが終わって、学生たちがライブラリを使うことで発見してくれた問題点の解決が主な内容です。利用して下さり、問題点を見つけてくれた学生のみなさまに感謝します。

内容は、
  • dd (double-double)用のfrexpが、入力が2のベキ乗よりも僅かに小さい値のときに正しく動作していなかったバグの修正。
  • interval.hppで、内部型としてfrexpが誤差を含む可能性があるような型を用いていたとき (例えばdd)、logがごく稀に正しい値を返していなかったバグの修正。
  • ddの(精度保証付きでない)sinとcosで、引き戻し処理が雑だったのを修正。
の3点です。特に、2番目は精度保証が破れている可能性があるため、重大な修正です。

ddのfrexpのバグ

frexpは、
    double x, y;
    int i;
    y = frexp(x, &i);
のように呼び出すと、xを入力として 0.5 ≤ |y| < 1, x = y × 2iを満たすようなyとiを計算してくれる関数で、(IEEE754の指数部とは1ずれるが)指数部を取り出してくれる関数としてよく用いられます。ddに対しても、
    kv::dd x, y;
    int i;
    y = frexp(x, &i);
のように同様に使える関数を用意していました。これの実装は、
    friend dd frexp(const dd& x, int* m) {
        double z1, z2;
        z1 = std::frexp(x.a1, m);
        z2 = std::ldexp(x.a2, -(*m));
        return dd(z1, z2);
    }
のようなものでした。しかしこれだと、xが(1, -2-54)のように2のベキ乗よりわずかに小さく、2のベキ乗と小さな負の数の和で表現されている場合、指数部を正しく取り出すことが出来ません。これを、
    friend dd frexp(const dd& x, int* m) {
        double z1, z2;
        z1 = std::frexp(x.a1, m);
        z2 = std::ldexp(x.a2, -(*m));
        if ((z1 == 0.5 && z2 < 0) || (z1 == -0.5 && z2 > 0)) {
            z1 *= 2;
            z2 *= 2;
            (*m)--;
        }
        return dd(z1, z2);
    }
のように修正する必要がありました。完全に作者の見落としであり、これを見つけてくれた学生には感謝しかないです。このバグが発生する確率は非常に低いので、かなりしつこく追い込まないと見つからない種類のバグだと思います。これにより、x = 1-2-54に対して、
x: 0.999999999999999944488848768742172978818416595458984375
y: 0.4999999999999999722444243843710864894092082977294921875
i: 1
のように誤った(0.5 ≤ |y| < 1を満たしていない)値を返していたのに対して、
x: 0.999999999999999944488848768742172978818416595458984375
y: 0.999999999999999944488848768742172978818416595458984375
i: 0
のように正しく計算されるようになりました。

interval<dd>のlogのバグ

前のddのfrexp問題に対処しているうちに、ある問題点に気付きました。それは、例えばx = 1+2-1074みたいな上位と下位の数が非常に離れたdd数に対して、誤差無しでfrexpを実行することが不可能であるという問題です。このxに対するfrexpは、
  • y = 0.5+2-1075
  • i = 1
となるべきですが、2-1075を今のdoubleで表現することは出来ません。よって、必然的に誤差が生じることになります。

frexpなんてあまり使わないし、誤差が生じることを断っておけばいいか、くらいに思ったのですが、ライブラリ内でfrexpを使っている箇所を探していたらありました、数学関数logです。log(x)を計算するのに、x=y×2iのように分解する方法を使っていました。そして、frexpに誤差が発生する可能性を考慮しておらず、frexpの戻り値を信用してそのまま計算していました。実際、doubleやmpfrではfrexpで誤差が発生することは無いのですが、ddだとこれが問題になります。

実際、log(1+2-1074)をinterval<dd>で計算すると、
[0,0]
のように誤った(真値を含まない)値が計算されました。frexpは、返却値のうち仮数部yが問題であり、指数部iは信頼できるので、指数部iのみ使って、yは改めて区間演算するように精度保証付きlogの計算方法を改めることで対処しました。これで、
[0,9.881312916824930883531375857364427447301196052286495288511713650013510145404
17503730599672723271984759593129390891435461853313420711879592797549592021563756
25260142638062280905569163433569796420737743727211399746144610001277481830712996
87746249467945463392302800634307707961482524771311823420533171133735363740791206
21249863890543182984910658610913088802254960259419999083863978818160833126649049
51429573802945356031871047722310026960705298694403875805362142149834066644536895
06671441664863872184765786916736120212023012339619506156684554636658495809965049
46155275185449574931216955640746893939906729403594535543517025132110239826300978
22029020757254763345019116747794671979873296198823284114052741805584855350891304
5817507736501283943653106689453125e-324]
のように正しい値を含む区間が返されるようになりました。

一応表現可能とはいえ、1+2-1074のような上位と下位が大きく離れたdd数が生成されることは稀であり、このバグに遭遇する確率は極めて低そうですが、可能性がゼロでない限り精度保証付き数値計算のライブラリとしては大きな問題と言えます。発見できて幸運でした。

ddのsin,cosの引き戻し問題

こちらは、精度保証付きのsin,cosでなく、sin,cosにintervalでない素のddを入れたときの問題です。元々ddに数学関数は実装されていなかったのですが、近似計算とはいえあれば便利だろうと、後で割と雑に実装したものです。が、sin,cosの引数を0近辺に引き戻すのに、2πを何度も引き算するようなあまりに雑な実装になっていました。多分後で直そうとして忘れていたものと思われます。元々精度保証は何も考えていない部分ですが、これだと大きな引数のときに計算時間が問題になりそうです。ちゃんと割り算するように直しました。

おわりに

ddは本当に鬼門で、何度も予想もしないバグに遭遇します。

精度保証付き数値計算のライブラリは、バグがあれば当然精度保証にならないわけで、プログラムにバグがないことをどうやって保証するのか、という宿命的な問題を抱えています。数学の定理の自動証明や、プログラムの自動検証を行うような研究もなされています。

(将来は分かりませんが)現在のところ、数学の定理が正しいかどうかは、多くの数学者が証明を検証してどうやら正しそうだ、と思えたら正しい、という段階のようです。プログラムも同じことで、大勢の人が使い、またソースコードを見て、どうやら正しそうだと思えたら正しい、とするしかないように思います。そのために、精度保証付き数値計算のプログラムは必ずオープンでなければならないし、また大勢の人に使われなければならないと考えています。
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